Pathogenität bezeichnet die Eigenschaft eines Objekts, bei einem bestimmten Organismus eine Erkrankung auszulösen. Das Adjektiv dazu lautet pathogen (krankheitsauslösend).

Im engeren Sinne meint die Pathogenität in der Mikrobiologie die Fähigkeit einer mikrobiellen Spezies (Bakterium, Virus, Protozoen), bei einem bestimmten Wirt als Krankheitserreger eine Erkrankung hervorrufen zu können. Ihr Gegenteil ist die Apathogenität, d.h. ein Krankheitserreger vermag in einem Wirt keine Erkrankung hervorzurufen. Das Adjektiv dazu lautet apathogen.

Je nach Art des Wirtes unterscheidet man:
- humanpathogen: Menschen betreffend
- zoo-, tierpathogen: Tiere betreffend
- phytopathogen: Pflanzen betreffend